- 2006년 6월, 그 기록들의 파이널! <태극기 휘날리며 SE> 대출시!
- Audio 부분 DTS 추가 수록
- 배우, 스탭이 참여한 2가지 음성해설 수록
- 시각 장애인용 음성해설, 청각 장애인용 영상 자막 삽입
- 총 410분 분량의 풍부한 스페셜 피쳐
- 부가영상물 디스크별 독립적 다큐멘터리 구성
- <태극기 휘날리며>를 만든 70여명 사람들의 추가 인터뷰 수록
- 초회 한정으로 장동건 or 원빈의 친필 싸인이 포함되었습니다.

1950년 6월.. 서울 종로거리에서 가족의 생계를 책임지기 위해 열심히 살아가는 ‘진태’는 힘든 생활 속에도 약혼녀 ‘영신’과의 결혼과, 세상에서 가장 소중하게 생각하는 동생 ‘진석’의 대학진학을 위해 언제나 활기차고 밝은 생활을 해 나간다.

6월의 어느 날, 한반도에 전쟁이 일어났다는 호외가 배포되면서 평화롭기만 하던 서울은 순식간에 싸이렌 소리와 폭발음, 그리고 사람들의 비명 소리로..

Disc 1

본편 1 (108분34초)
Commentray Track1 : 강제규,장동건,원빈
시각 장애인용 음성해설
청각 장애인용 영상자막

Disc 2

본편2 (49분31초)
Commentray Track2 : 강제규 감독,이성훈 PD,홍경표 촬영감독,심보경 프로덕션 디자이너
시각 장애인용 음성해설
청각 장애인용 영상자막

Disc 3 - - Speacial Features Part 1 (233분)

태극기 휘날리며 감상소감 (5분)
태극전사들의 열정 (60분)
투자,배우,감독이야기
쵤영의 긴여정 (촬영,조명,그림) (25분)
멀티 앵글 촬영 (10분) : 풍경,1950년
1950년을 찾아 : 헌팅 및 주요 컨셉 (15분)
세트 미술(30분)
그때 그 사람들 (20분)
스틸 갤러리
만년필에서 탱크까지 (25분)
신규보직(15분)
스케줄 매니져,총기관리,그림팀
사용된 무기
: 국군무기
: 인민군 무기
태국 아리아(25분)
음악감독,싱크로 스위밍,음악감상회 : World Spot(8분)
예고편,Tv Spot,일본판/미국판/홍콩판

Disc 4 - Speacial Features Part 2 (177분)

시각효과 (VFX)
시각효과 (강종익, MCC) (38분)
Pre Visual
2D 합성 전과 후
3D 합성 전과 후
: 특수부대 (27분)
특수효과, 특수요원 : 소리를 찾아서
음향효과 (20분)
음향 믹싱 전과 후 (10분) : 편집 (15분)
퍼스트 편집, 현장편집 : 디지털 색보정 (15분)
디지털 색보정 (디지털 색보정 기사, 현장기사, 촬영감독)
디지털 색보정 전 과 후 : 홍보 마케팅 (30분)
프리미어 시사회 및 각종 시사회
해외 개봉 스케치 (일본, 미국)
부가사업 : 휘날리는 태극기를 보내며 (15분)
마지막 촬영과 함께, 마지막 인터뷰